Na przestrzeni lat, Szpital i jego Pracownicy otrzymywali następujące nagrody:
- wyróżnienie w Warmińsko-Mazurskiej Nagrodzie Jakości w kategorii „W Uznaniu Dla Doskonałości Zarządzania” – edycja 2003,
- wyróżnienie w Warmińsko-Mazurskiej Nagrodzie Jakości w kategorii „Zaangażowanie w Doskonałość Zarządzania” – edycja 2004,
- nagrodę główną w Warmińsko-Mazurskiej Nagrodzie Jakości – edycja 2006,
- wyróżnienie w XIII Edycji Polskiej Nagrody Jakości – 2007,
- wyróżnienie w konkursie „Mama w pracy” oraz otrzymał tytuł ‚Firma nieprzeciętnie przyjazna matkom” – 2007,
- wyróżnienie w kategorii „Usługa medyczna” w III edycji konkursu „Najlepszy Produkt i Usługa Warmii i Mazur” – 2007,
- nagrodę główną w XV Edycji Polskiej Nagrody Jakości – 2009,
- laur „Najlepszym z Najlepszych” w kategorii „Usługa medyczna” – 2010,
- nagrodę w Ogólnopolskim Rankingu Szpitali “Bezpieczny Szpital 2011” w kategorii szpitali niezabiegowych,
- nagrodę w XII Edycji Rankingu „Gazele Biznesu” 2011,
- certyfikat: „Produkt Warmia Mazury” 2014 za kompleksową rehabilitację dzieci i młodzieży,
- nagrodę w konkursie Najlepszy Produkt i Usługa Warmii i Mazur w kategorii – usługa – Kompleksowa rehabilitacja dzieci i młodzieży” 2019,
- laur w konkursie „Dziecięcy Szpital Przyszłości” w kategorii “Pacjent w Centrum”, za projekt “Opieka Zorientowana na Osobę” 2021,
- laur Marszałka Województwa Warmińsko-Mazurskiego – „Najlepszym z Najlepszych”2022,
- laur kategorii “Pacjent w Centrum” w konkursie “Dziecięcy Szpital Przyszłości” którego organizatorem była Fundacja KIDS 2021,
- 5 miejsca w kategorii „Nowatorskie produkty i usługi poprawiające jakość życia, zdrowia i dostęp do usług” w konkursie Zdrowa Przyszłość 2022 – Inspiracje Bezpieczny Szpital Przyszłości,
- laur Nagród Gospodarczych Żagle Warmii i Mazur – 2022,
- laur „Najlepszym z Najlepszych” – 2022 Nagroda przyznawana jest przez Marszałka Województwa Warmińsko-Mazurskiego,
- laur „Najlepszym z Najlepszych” – 2023 Nagroda przyznawana jest przez Marszałka Województwa Warmińsko-Mazurskiego,
- 3 miejsce w województwie warmińsko-mazurskim, w plebiscycie Hipokrates w kategorii „Szpital Roku”
- Laureat Ogólnopolskiego konkursu Lider Zaufania Pacjentów organizowanego przez Europejskie Centrum Badań nad Jakością – 28 czerwca 2024
- Wyróżnienie nadzwyczajne Złoty Laur w Obsłudze Pacjenta Ogólnopolskiego konkursu Lider Zaufania Pacjentów organizowanego przez Europejskie Centrum Badań nad Jakością – 28 czerwca 2024
- Laureat l miejsca w kategorii “Działania na rzecz ochrony zdrowia i środowiska naturalnego” w konkursie Zdrowa Przyszłość Inspiracje za projekt Północnego Centrum Psychiatrii Dziecięcej wraz z Urzędem Marszałkowskim Województwa Warmińsko-Mazurskiego – 7 listopada 2024
- Laureat IV miejsca w konkursie Zdrowa Przyszłość Inspiracje w kategorii “Nowatorskie rozwiązania, produkty I usługi poprawiające jakość życia, zdrowia, dostęp do usług” – 7 listopada 2024
- I miejsce w konkursie organizowanym przez Fundację KIDS Klub Innowatorów Dziecięcych Szpitali w kategorii Centrum Innowacji za nowatorski projekt: „Sztuczna Inteligencja jako wsparcie w podejmowaniu decyzji medycznych” – 15 listopada 2024
- Wyróżnienie jako Ceniony Pracodawca przez Fundację KIDS Klub Innowatorów Dziecięcych Szpitali w kategorii Centrum Innowacji – 15 listopada 2024
- Brązowy Laur “Najlepszym z Najlepszych” w kategorii Zdrowie – nagroda Marszałka Woj. Warmińsko-Mazurskiego – 24 kwietnia 2025.