Na przestrzeni lat, Szpital i jego Pracownicy otrzymywali następujące nagrody:
- wyróżnienie w Warmińsko-Mazurskiej Nagrodzie Jakości w kategorii „W Uznaniu Dla Doskonałości Zarządzania” – edycja 2003,
- wyróżnienie w Warmińsko-Mazurskiej Nagrodzie Jakości w kategorii „Zaangażowanie w Doskonałość Zarządzania” – edycja 2004,
- nagrodę główną w Warmińsko-Mazurskiej Nagrodzie Jakości – edycja 2006,
- wyróżnienie w XIII Edycji Polskiej Nagrody Jakości – 2007,
- wyróżnienie w konkursie „Mama w pracy” oraz otrzymał tytuł ‚Firma nieprzeciętnie przyjazna matkom” – 2007,
- wyróżnienie w kategorii „Usługa medyczna” w III edycji konkursu „Najlepszy Produkt i Usługa Warmii i Mazur” – 2007,
- nagrodę główną w XV Edycji Polskiej Nagrody Jakości – 2009,
- laur „Najlepszym z Najlepszych” w kategorii „Usługa medyczna” – 2010,
- nagrodę w Ogólnopolskim Rankingu Szpitali “Bezpieczny Szpital 2011” w kategorii szpitali niezabiegowych,
- nagrodę w XII Edycji Rankingu „Gazele Biznesu” 2011,
- certyfikat: „Produkt Warmia Mazury” 2014 za kompleksową rehabilitację dzieci i młodzieży,
- nagrodę w konkursie Najlepszy Produkt i Usługa Warmii i Mazur w kategorii – usługa – Kompleksowa rehabilitacja dzieci i młodzieży” 2019,
- laur w konkursie „Dziecięcy Szpital Przyszłości” w kategorii “Pacjent w Centrum”, za projekt “Opieka Zorientowana na Osobę” 2021,